iis8.xで1つのIPアドレスで複数のSSLサイトを構築するには、 各サイトへバインドを行う必要があります。マルチドメイン証明書をお使いの方は以下の手順を参考にしてください。
(1)　IISマネージャから設定する。

■ステップ1　現在の構成状態が下記のとおりであると仮定して作業を進めます

名前 ホスト名 ポート80 ポート443
Default Web Site www.yourdomain.com バインド済み バインド済み
www2.yourdomain.co.jp www2.yourdomain.co.jp バインド済み
www3.yourdomain.net www3.yourdomain.net バインド済み

すでにマルチドメイン証明書はインストール済みで、追加で　www2.yourdomain.co.jp のサイトにhttps(ポート443)のバインドを追加します。
サイトの名前、ホスト名はお客様の環境に置き換えて下さい。

■ステップ2　対象サイトにサーバ証明書を適用する

  1. 「インターネットインフォメーションサービス（IIS）マネージャ」を開き、SSLを有効にするサイトを選択して「操作」メニューの「バインド」をクリックします。
    Microsoft IIS 7.0 SSLサーバ証明書インストール06

  2. 「サイトバインド」画面が表示されます。
    「追加」ボタンをクリックします。
    Microsoft IIS 7.0 SSLサーバ証明書インストール07
  3. 「サイトバインドの追加」画面が表示されます。
    ｢種類｣では [https] を、「SSL証明書」ではインストールしたマルチドメイン証明書のフレンドリ名(*)を選択します。
    [ホスト名] ボックスに、サイトのホスト ヘッダー名を、「www2.yourdomain.co.jp」のように入力します。
    Microsoft IIS 7.0 SSLサーバ証明書インストール08
    (*)フレンドリ名ではなく、コモンネームが表示されることがあります。
    「OK」をクリックすると設定は完了です。

    【ご注意】
    フレンドリー名の頭が*で始まっていない場合は [ホスト名] ボックスがグレイアウトの状態で、ホスト名が入力できません。 この場合はいったん作業を中止して、フレンドリー名の頭を*に変更してから作業をやり直して下さい。 あるいはコマンドラインからバインドを設定して下さい。

以上で追加ドメインwww2.yourdomain.co.jpの適用が完了しました。
引き続き追加したいドメインがあれば、「ステップ2　対象サイトにサーバ証明書を適用する」の作業を繰り返して下さい。

(2)　コマンドラインから設定する。

appcmd set site /site.name:"サイト名" /+bindings.[protocol='https',bindingInformation='*:443:ホスト名']

[入力例]
c:\Windows\System32\inetsrv>appcmd set site /site.name:"www2.yourdomain.co.jp" /+bindings.[protoco l='https',bindingInformation='*:443:www2.yourdomain.co.jp']
SITE オブジェクト "www2.yourdomain.co.jp" は変更されました

以上で追加ドメインwww2.yourdomain.co.jpの適用が完了しました。
引き続き追加したいドメインがあれば、コマンドラインからの設定作業を繰り返して下さい。